עם סגירת הרישום בהיכלי הישיבות לקראת זמן אלול תשפ"ב, ביקר הגאון הרב זמיר כהן, ראש ישיבת אבני נזר, במעונו של נשיא מועצת חכמי התורה ראש הישיבה הגר"ש כהן לברכה והתייעצות.
במהלך הדברים הרחיב הגר"ש כהן בדרך הלימוד וההנהגה בהיכלי הישיבות ועורר על חשיבות ההקפדה על תפילות בישיבה. "יש להקפיד מאד שבחורים יתפללו שחרית בהיכל הישיבה, יש בכך חשיבות גדולה", אמר נשיא המועצת. "המשגיחים בישיבות צריכים להלהיב את לבבות הבחורים להתפלל בישיבה, ישיבה זה לא רק לימוד תורה, זה לימוד תורה ויראת שמים, ויראת שמים זה תפילה".
בדבריו הרחיב ראש הישיבה בדרך הלימוד והמסכתות שחשוב שילמדו בסדרי העיון, ואמר כי "יש לשלב בסדר המסכתות של הלימוד בעיון גם מסכתות מסדר מועד, כגון סוכה, פרקים מסוימים ממסכתות שבת ופסחים, ופרק אחרון ממסכת יומא. זה נותן לבחורים ידיעות יסודיות שנצרכות לחיי היום יום".
נשיא המועצת ביקש בדבריו לעורר בקרב בני הישיבות על פגעי הטכנולוגיה ואמר: "בחור שמחזיק אייפון יש להוציאו מהישיבה כי זה שורש כל הקלקולים ונזק לכל הבחורים בישיבה ואפילו לחילול שבת רח"ל מגיעים מזה".
בסיום השיחה סיפר הגר"ז כהן לנשיא המועצת על התפתחות הישיבה שקיבלה 56 בחורים ל'זמן אלול' הקרוב.
הגר"ש כהן אחז בידיו של הגר"ז והתבטא בשמחה: "אשרינו שזכינו שעולם התורה הספרדי הולך וגדל, זהו הנחת הגדול לקודשא בריך הוא".