באיראן מאשימים את ישראל בחיסול הדרמטי של, מוחסן פחריזאדה, אבי הגרעין האיראני: "סימנים ברורים למעורבות ישראלית".
שר החוץ של איראן, מוחמד זריף, אמר לאחר החיסול כי: "טרוריסטים רצחו היום מדען איראני בכיר. המעשה הפחדני - עם סימנים ברורים למעורבות ישראלית - מראה על חרחור מלחמה על ידי פושעים.
"איראן קוראת לקהילה הבינלאומית - ובמיוחד לאיחוד האירופי - להפסיק עם המוסר הכפול ולגנות את מעשה הטרור הזה".
עלי חמינאי, המנהיג הרוחני העליון של איראן, כתב בטוויטר: "אחד המדענים המבטיחים שלנו בתחום הגרעין וההגנה נרצח על-ידי מתנקשים אלימים, הישגיו המדעיים גרמו לו לשלם על כך בחייו ולזכות בתואר שהיד".
נשיא איראן, חסן רוחאני, אמר: "העם שלנו נבון יותר, ולא ייפול בפח של המשטר הציוני. איראן בוודאי תגיב למותו של המדען שלנו בזמן הנכון
כמו כן, באיראן פנו לאו"ם וטענו כי בידיהם יש "אינדיקציות רציניות" כי ישראל היא זו שעומדת מאחורי החיסול בסמוך לעיר טהרן.