קנאי לונדון התנגדו לרבם ר' דוד ניטו, ומררו את חייו. שני הצדדים פנו לבית דין בראשות החכם צבי, ולאחר שנתיים ימים בהם ישב החכם צבי על המדוכה, הוא פסק לטובת רבי דוד ניטו וטיהר אותו מכל אשמת כפירה (היסטוריה)