בצה"ל סיימו לפני זמן קצר את התחקיר הראשוני מפיגוע הירי שהתרחש הבוקר (שישי) באזור נאות הכיכר שעל יד ים המלח סמוך לגבול הירדני. מהתחקיר עולה כי תצפיתניות צה"ל זיהו את המחבלים כבר בשלבי החדירה הראשוניים והם הכריזו את פקודת הקוד "פרש טורקי" המתריעה על חשש לחדירת מחבלים לישראל.
מיד לאחר הכרזת הפקודה, בתוך 10 דקות, מופיע באזור רכב סיור צה"לי ועליו חמשה לוחמים שהגיעו לנקודה החשודה על הגבול. בשלב זה, המחבלים מזהים את רכב הסיור ופותחים לעברו באש מאקדחי 'גלוק' שהיו ברשותם.
הלוחמים משיבים באש ומחסלים את המחבלים שהצליחו לחצות את הגבול הירדני למרחק 300 מטרים, אבל עדיין בתוך שביל הטשטוש. מחבל אחד חוסל במקום, והמחבל השני עוד הספיק להתקרב ולהגיע למרחק של כ-30 מטרים מרכב הסיור הצה"לי כשאש הלוחמים הכריעה אותו והוא חוסל גם הוא.
במשך שעות לאחר חיסול המחבלים, בצה"ל סרקו את האזור על מנת לשלול חשד למחבל שלישי ונוסף שהצליח לחדור לתוך השטח הישראלי. רק בתום המצוד נשלל החשד למפגע נוסף ובצה"ל הודיעו על חזרה מלאה לשגרה.
בתחקיר הפיגוע והחדירה עולה כי המחבלים הגיעו לבושים במדי הצבא הירדני כשהם מצויידים בקאטר לחיתוך הגדר, משקפת, סכין קומנדו, מפה של ישראל ו'שיחון' לתרגום ערבית - עברית.
בצבא הירדני קיימו שיחות עם גורמים ישראליים וטענו כי המחבלים לא שירתו בצבא הירדני. כעת נבדקת זהותם על ידי השב"כ והרשויות בירדן.
המחבלים הספיקו לירות 8 קליעים ברכב הסיור הצה"לי ולפצוע שני לוחמים בדרגה קלה. ברשותם של המחבלים נמצאו מחסניות נוספות.
בתוך כך, בבית החולים הדסה עין כרם בירושלים, מסרו עדכון על מצב הלוחמים שנפצעו מירי המחבלים שחדרו מירדן לישראל: "אל יחידת הטראומה בהדסה עין כרם פונו במסוק שני פצועים מארוע פח״ע בים המלח. שניהם סובלים מפצעי ירי בפלג הגוף התחתון ונמצאים בהכרה, אחד במצב קל והשני בינוני. צוות יחידת הטראומה בהדסה עין כרם מבצע בדיקות הדמיה ויקבע המשך טיפול".