הפרקליטות הצבאית הגישה הצהרת תובע נגד אבראהים מנצור, פלסטיני כבן 22, בחשד לרצח סוהר שירות בתי הסוהר יוחאי אבני ז"ל בביתו. עם זאת, בכתב האישום לא יופיע סעיף של רצח על רקע לאומני, מה שהעלה את זעם משפחת אבני: "אם זה לא פיגוע לאומני, מה זה?".
כזכור, אבני הי"ד אותר ללא רוח חיים בבית מגוריו בגבעון החדשה עם פצעי דקירה רבים בגופו. למקום הוזעקו כוחות משטרה של מחוז ירושלים יחד עם גורמי החירום וההצלה.
כבר מאיסוף ממצאים ראשוני בזירה עלה החשד לרצח. בעקבות המקרה, הוקם צוות חקירה משותף ליחידה המרכזית במשטרת מחוז ירושלים ושירות הביטחון הכללי, על מנת שיגיעו לחקר האמת ולגילוי הרוצח.לאחר פעולות חקירה ראשוניות שבוצעו עוד באותו היום, הצליחו חוקרי ימ״ר ירושלים ושב״כ להתחקות אחר זהותו של החשוד ברצח.
יומיים לאחר שאותרהנרצח, בתאריך 10.7, נעצר החשוד ברצח אבראהים מנצור, פלסטיני כבן 22, תושב הכפר בידו.
מהחקירה במשטרה ובשב״כ עולה כי בתאריך 7.7 במהלך שעות הלילה המאוחרות, הגיע החשוד לישוב גבעון החדשה כשהוא ללא היתרי שהייה בישראל. לאחר שחדר לתחומי הישוב, החשוד ניסה לפרוץ למספר בתי מגורים בישוב ללא הצלחה.
בשלב זה פרץ לבית שאותו שכר יוחאי ז״ל בישוב, ונכנס אליו דרך החלון, בשעה שהמנוח ישן. במקום התפתח מאבק פיזי בין יוחאי ז״ל לרוצח, שבמהלכו נטל החשוד חפץ חד ודקר את יוחאי ז״ל מספר רב של פעמים עד שהתמוטט על הרצפה. בהמשך דקר אותו גם בסכין גדולה נוספת שלקח ממטבח הבית, ובעוד יוחאי גסס בדירה דקר אותו דקירה קטלנית נוספת בצווארו ורצח אותו.
מהחקירה בימ״ר ירושלים ושב״כ עולה כי לאחר מעשה הרצח האכזרי, הרוצח גנב מהדירה מספר פריטים שעמם נמלט מהמקום. לפני שעזב את הדירה, הצית אש בתוכה, וכתוצאה מכך פרצה שריפה שנכבתה מעצמה בתוך זמן קצר. הרוצח ברח מהישוב ליהודה ושומרון ובדרכו לביתו שרף את הפריטים שגנב מדירתו של המנוח.
במסגרת החקירה בימ״ר ירושלים ובשב״כ נעצרו שני חשודים נוספים, קרובי משפחתו של הרוצח. חקירתם שללה מעורבות שלהם במעשה הרצח האכזרי, שבוצע ע״י הרוצח לבדו.
כמו כן, בשב"כ הדגישו כי בחקירה לא עלה כל מידע שיכול להצביע על קשר בין מקום עבודתו של יוחאי ז״ל בשב״ס לרצח או כל אפשרות להיכרות מוקדמת ביניהם.