ראש הממשלה נתניהו קיבל את המידע על האסון במג'דל שמס, בעיצומה של שבת קודש ובעת ששהה במיאמי, במסגרת ביקורו המדיני בארה"ב, מי שניסה לקחת שליטה על האירוע, הוא שר הביטחון גלנט.
בהודעה שיצאה אמש מטעמו של שר הביטחון גלנט, נכתב: "לעדכונכם, שר הביטחון יואב גלנט סיים כעת הערכת מצב מורחבת, בהשתתפות הרמטכ״ל רב-אלוף הרצי הלוי, ראש השב״כ רונן בר, ראש המוסד דדי ברנע, מנכ״ל משרד הביטחון אלוף (מיל׳) אייל זמיר ובכירים נוספים במערכת הביטחון".
עוד נכתב בהודעה: "במהלך הדיון, גורמי הביטחון הציגו לשר את אפשרויות הפעולה נגד חיזבאללה בתגובה לאירוע החמור של רצח האזרחים במג׳דל שמס. השר גלנט קבע את כיווני הפעולה והנחה את מערכת הבטחון בהתאם".
בכאן 11 דווח הערב (ראשון), כי בסביבת ראש הממשלה נתניהו זועמים על ההודעה שהוציא שר הביטחון, בעת שנתניהו הסתפק האם לחזור לישראל באמצע שבת.
על פי הדיווח, בסביבתו של רה"מ נתניהו, תדרכו שרים בממשלה כי גלנט "רוצה לקבל החלטות ולנהל את המלחמה לבד". המתיחות הזו מצטרפת לשורת מתיחויות בין שני האישים, שהחלה עוד כשנתניהו רצה להעביר את הרפורמה המשפטית וגלנט התנגד, והמשיכה גם בעת המלחמה.