ראש הממשלה בנימין נתניהו השוהה בלוס אנג'לס שוחח עם הרמטכ"ל בני גנץ וראש המוסד תמיר פרדו ובירכם על תפיסת ספינת הנשק על-ידי לוחמי השייטת לפנות בוקר.
"אני מבקש לברך את צה"ל, את גופי המודיעין ואת חיל הים שביצעו כאן מבצע מושלם של תפיסת ספינת נשק איראנית חשאית", אמר ראש הממשלה.
נתניהו הוסיף ואמר: "בשעה שאיראן מחייכת ואומרת כל מיני דברי נועם, אותה איראן שולחת נשק קטלני לאירגוני הטרור והיא עושה את זה ברשת מסועפת של מבצעים חשאיים חובקי עולם במטרה להזרים רקטות, טילים וכלי נשק קטלניים אחרים כדי לפגוע באזרחים חפים מפשע. זאת איראן האמיתית ואסור שהמדינה הזאת תקבל לידיה נשק גרעיני. נמשיך לעשות כל מה שצריך כדי להגן על אזרחי ישראל".
שר הביטחון משה בוגי יעלון אמר כי "על אוניית הנשק האיראנית התגלו אמצעי לחימה בעלי משמעות אסטרטגית, בהם רקטות לטווחים שונים אשר היו מיועדים להגיע לארגוני הטרור ברצועת עזה דרך סודן".
במשרד החוץ בירושלים הגיבו ואמרו: "איראן חוזרת ומפרה את החלטות מועצת הביטחון 1747 ו-1929, האוסרות עליה לייצא נשק כלשהו. בהברחת הנשק לרצועת עזה היא מפרה את החלטות מועצת הביטחון 1373 ו-1860".
"איראן ממשיכה לסכן נתיבי שיט בינלאומיים ולהפר בגסות שורת החלטות של מועצת הביטחון במטרה לערער את היציבות באזור ולהפיץ טרור", נמסר ממשרד החוץ.
במשרד החוץ הודיעו כי "ישראל תגיש תלונה רשמית למועצת הביטחון באו"ם".
יו"ר האופוזיציה, יצחק (בוז'י) הרצוג, אמר כי "טוב עשה הדרג המדיני שהורה על הפעולה. אני מברך את צה"ל ואת מפקדיו וחייליו על פעולתו המוצלחת. מול הטרור אין פשרות מלבד להלחם בנחרצות ובנחישות בכל אתר ואתר".
"האמל"ח שבאוניה היה מיועד לפגוע באזרחי המדינה בלי הבדלי דעות ומפלגות. בד בבד עם פעילות צבאית חיוני להמשיך לחזק את הגורמים המתונים באזור ולקיים איתם דיאלוג ושיתופי פעולה למען השלום והביטחון באזור", הוסיף הרצוג.
בתוך כך, שרי הממשלה קיבלו הוראה מלשכת ראש הממשלה שלא להתראיין בשלב זה על תפיסת ספינת הנשק האיראנית.
לפנות בוקר השתלטו לוחמי השייטת של חיל הים על הספינה KLOS-C בים האדום ואיתרו מאחורי שקי מלט עשרות טילי M-302 שהועמסו באיראן, הועברו לסודאן ואמורים היו להיות מועברים יבשתית לארגונים ברצועת עזה.
וחמי השייטת בצעו את ההשתלטות כ-1,500 קילומטרים מחופי ישראל, בלב הים האדום סמוך לחופי סודאן. הספינה KLOS-C ועליה דגל פנמה עשתה את דרכה מאיראן לרצועת עזה כספינת סוחר תמימה. בשעה 5:30 לפנות בוקר השתלטו הלוחמים על הספינה שנשאה עשרות טילי M302 המסוגלים להגיע לטווח של עד 200 ק"מ שהוסתרו מאחורי שקי מלט.
הטיל שנמצא על הספינה הוא בעל ראש קרבי של יותר ממאה קילוגרמים, מיוצר בסוריה בעזרת טכנולוגיה איראנית. הרמטכ"ל, רב-אלוף בני גנץ שפיקד על המבצע מהבור בקריה נתן את האישור למפקד חיל הים, אלוף רם רוטברג, שהיה בזמן המבצע על סטי"ל בלב ים.