תיעוד חדש ממצלמות האבטחה בכפר פונדק חושף את ההתפרעויות שביצעו עשרות צעירים יהודים, רעולי פנים בכפר. הצעירים נראים מגיעים אל הכפר ומעלים באש רכב ומבנה סמוך.
זמן קצר לאחר מכן, שני צעירים נפצעו באורח קשה מירי שביצעו שוטר וחייל סמוך לרמת גלעד, ופונו לבית החולים 'מאיר' בכפר סבא, בהמשך הלילה אחד מהם הועבר לבית החולים בילינסון בפתח תקווה והצעיר השני נותח ומצבו קשה.
מהתחקיר הראשוני של צה"ל על האירועים הלילה עולה, כך לפי הפרסום של העיתונאי איתי בלומנטל, הכתב הצבאי של 'כאן חדשות', כי עשרות יהודים רעולי פנים נכנסו בסביבות השעה 21:30 בערב לחלק המערבי של הכפר, והחלו להצית כלי רכב, מבנים וחממה.
כוח מג"ב שהיה באזור זיהה את הפורעים, אך כאשר הוא התקרב אליהם - הם החלו להימלט לכיוון הכפר הסמוך ג'ינסאפוט. בשלב זה, מספר יהודים רעולי פנים נכנסו לרכב וניסו להימלט מהאזור.
ניידת משטרה עצרה את הרכב והצעירים ירדו מהרכב והתחילו לברוח. אחד השוטרים רדף אחרי שני צעירים יהודים, שירדו לוואדי הסמוך - שם הוא הצליח לעצור אותם אחרי מרדף.
בשלב זה החל עימות פיזי ביניהם, השוטר טוען כי קיבל מכות והם התיזו עליו גז פלפל לעיניים. בעקבות כך הוא ירה מספר קליעים באוויר, ירי אזהרה, במסגרת נוהל מעצר חשוד - ומהירי הזה שני הצעירים נפגעו.
השוטר טען עוד כי הוא לא כיוון את הירי לעברם אך ייתכן שהם קפצו עליו תוך כדי הירי וכך הם נפגעו. העובדה שהשניים נפגעו בפלג גופם העליון מתכתבת עם טענתו של השוטר. בשלב זה החקירה נמשכת.
דובר צה"ל מסר כי "מפקד פיקוד המרכז, אלוף אבי בלוט, מפקד אוגדת יהודה ושומרון, תא״ל יקי דולף, ראש המנהל האזרחי, תא״ל הישאם אבראהים ומפקד חטיבת אפרים, אל״ם נתנאל שמכה, ערכו תחקיר ראשוני בשטח לאחר אירוע הפרות הסדר בפונדוק.
"מהתחקיר עולה כי אמש (ב׳) עשרות אזרחים ישראלים, חלקם רעולי פנים הגיעו בשעות הלילה לאזור פונדוק שבחטיבת אפרים, הציתו רכוש וגרמו לנזק. עם קבלת הדיווחים כוחות של צה״ל ומשטרת ישראל קפצו לנקודה. האזרחים זרקו אבנים ותקפו את כוחות הביטחון. בעקבות האירועים נפתחה חקירה משותפת של המחלקה לחקירות שוטרים והמשטרה הצבאית החוקרת".
מפקד פיקוד מרכז, האלוף אבי בלוט, אמר בנקודת האירוע כי ״כל הפרת סדר אלימה פוגעת בביטחון וצה״ל לא יאפשר אותה".
הלילה, הודיעה המשטרה כי לאור המעורבות של שוטר וחייל באירוע ולבקשת משטרת ישראל, זומנו מח"ש (מחלקה לחקירת שוטרים) ומשטרה צבאית חוקרת לזירה.
עוד נמסר כי מפקד מחוז ש"י ניצב פינצי משה מבצע הערכת מצב בשיתוף גורמי צה"ל. מצה"ל מסרו אמש כי "מפקד פיקוד המרכז, מפקד אוגדת איו״ש וראש המנהל האזרחי צפויים לקיים הלילה תחקיר ראשוני בשטח".
הבוקר נמסר מהמחלקה לחקירות שוטרים כי "צוות מרכז במחלקה לחקירות שוטרים הגיע הלילה לזירת אירוע הירי בשומרון, בו נפצעו שני אזרחים, ופתח בחקירה. בהמשך, חקרו באזהרה שוטר בחשד לירי שלא כדין.
"בתום החקירה שוחרר השוטר למעצר בית עד ליום שישי, הורחק ל-8 ימים מתחנות המשטרה וממתקנים משטרתיים, ונאסר עליו ליצור קשר עם המעורבים באירוע. החקירה נמשכת".