אמנם מבקר המדינה הקפיא את בדיקותיו בנושאי ה-7 באוקטובר, לאור פסיקת בג"ץ, אולם מהבדיקות שעוד הספיק לערוך בטרם הוקפאה בדיקתו, הצליח המבקר אנגלמן להצביע על שורת כשלים במערך זיהוי גופות נרצחי מתקפת הפתע של חמאס על עוטף עזה, בבוקר שמחת תורה ה-7 באוקטובר, כשלים שגרמו לקבורה של נרצחים שונים - יחד.
לפי הדיווח ברשת ב', אנגלמן זיהה כי בבוקר שמחת תורה, אולי בשל ריבוי הנרצחים הי"ד, התקבלה החלטה שלא לערוך לנרצחים בדיקת CT. אמנם מספר הבדיקות של כל מערכת CT מוגבלת למספר קצוב לכל שעה, אבל היעדר השימוש בבדיקה הקריטית, הוביל לכך שבשקיות שהובאו מהעוטף, עורבבו בשגגה חלקי גופות שונים שנטמנו בקבר אחד.
ההתנהלות הזו הובילה לכך שמספר אזרחים שנרצחו כבר בבוקר שמחת תורה, הוכרזו נעדרים תקופה ארוכה. בחלק מהמקרים, שוהו הנרצחים רק לאחר פתיחת קברים שנחשדו כי האדם שנטמן בהם היה בקרבתו של הנעדר בשעת הטבח, וכך שוהו נרצחים נוספים.
עוד עולה מבדיקת המבקר, כי בניגוד לנהלי "שגרה", הרי שבבוקר שמחת תורה התקבלה החלטה שלא לצלם את הגופות ובחלק מהמקרים "דילגו" על ההוכחות הפורנזיות - הוכחות שעשויות לשמש בעיקר את הנצחת זוועות הטבח המזעזע ביותר מאז קום המדינה.
המבקר לא מתעלם מהעובדה, כי הגורמים שעסקו במלאכת הזיהוי, עמדו בפני אתגר חסר תקדים במונחים היסטוריים, גם מבחינה בינלאומית. כמות הגופות היא הגדולה בהיסטוריה של המדינה, כמו כן השטח הרחב עליו התפרסו מעשי הזוועות.
בנוסף, גופות רבות חוללו והושחתו בצורה שהקשתה עוד יותר על מלאכת הזיהוי, וחיילי צה"ל המשרתים בשורה, מלבד ההתמודדות עם מראות טראגיים, נאלצו להתמודד גם עם הכמות והקושי ההזויים, בפרק זמן קצר מאוד.