מדי שנה עורך מכון פוע"ה כנס הלכתי שנתי על סוגיית רפואת נשים, התמודדיות הילכתיות וחידושים רפואיים.
לכנסים האלה מוזמנים מגדולי הרבנים בישראל כמו הרבנים הראשיים לישראל הרב שלמה עמאר, הרב דייכובסקי, הרב יונה מצגר, הרב יעקב אריאל רבה של רמת גן, הרב דב ליאור.
גם בכירי הרופאים באים להרצות על ענייני הרפואה שמתחדשים מדי שנה. הכנס ברובו הוא הילכתי ומטבע הדברים וגם בגלל כבוד הרבנים והציבור הדתי והחרדי שמשתתף בכנס - נשים לא מרצות ולא נושאות דברים לפני הקהל.
אבל הרגישות הדתית לא עשתה רושם על ארגון הנשים 'קולך' שזעמו על מכון פוע"ה שלא אפשרו לתת לנשים רופאות לדבר לקהל הרחב. קולך שיגרו מכתב נזעם אל הרופאים שאמורים להרצות בכנס וקראו להם להחרים את הדיונים שמארגן מכון פועה.
אנשי מכון פוע"ה שלחו מיד מכתב הרגעה לאותם רופאים שקיבלו את מכתבי קולך שלא יבטלו את השתתפותם בכנס. "נודע לנו כי נשלח אליך מכתב מארגון 'קולך' ובו נקראת להדיר רגליך מכנס בריאות האשה בו הוזמנת להרצות. ב"ה, באופן מעשי אף מרצה לא ביטל את השתתפותו, אך חשבנו שחשוב להביא לידיעתך את הדברים הבאים למרות היותם בוודאי ידועים ומפורסמים. מזה כעשור מתכנסים אל הכנס השנתי של מכון פוע"ה כאלף וחמש מאות איש ואישה (ובכללן נשות "קולך"), אשר באים לשמוע את בכירי הרופאים והרבנים בישראל, העוסקים בסוגיות של פוריות, רפואה והלכה, תוך מאמץ מתמיד למצוא מענה בהיבטים השונים."
אנשי פוע"ה מבקשים מהרופאים להבין את הרגישות הדתית של הרבנים ושל הציבור שמשתתף בכנס וטוענים כי קולך מנסים להוליך שולל: "מתוך רגישות לדרישות הגוונים השונים שבציבור השומעים והמגיעים לכנס אנו מזמינים להרצות בכנס השנתי נושאי דברים. במקביל לכנס מקומן של הנשים אינו נפקד ואנו זוכים לשמוע ולהשמיע רופאות רבות ובכירות ונשות אמונה, חינוך והלכה בימי עיון רבים, שהמכון עורך במהלך כל השנה. יצוין, כי בלעדי רגישות זו, ציבור שלם לא יוכל לקחת חלק בכנס הן כנושאי דברים והן כקהל הרחב, בשל הפגיעות ההלכתית שבעניין כלפיהם.
"פועה טוענים שקולך מנסים להטעות את הרופאים. "לצערנו, ארגון "קולך", בחר להכפיש ולהטעות, כשבחר לפנות אליך במכתב ובו קריאה שאינה עולה בקנה אחד עם ליברליות וכבוד לזולת גם אם אינך מסכים עימו, תוך שהוא מטיל דופי בארגון העוסק ימים ולילות במענה לזוגות ולציבור רחב ביותר בעם ישראל.
"אנו תמהים על חוסר האחריות והרגישות מצד ארגון "קולך" כלפי ציבור רחב וחשוב (ובכללם נשים רבות המהוות כמחצית מבאי הכנס) אשר זוכים להפיק תועלת רבה ולהתעדכן בכנסים אלו ומהרופאים המשתתפים בו. בשנה שעברה העליל ארגון "קולך" בתקשורת, האשמות שאין להם שחר, כי הכנס מתנהל באופן של הסתרת הנשים, אפליית נשים בשאילת שאלות ועוד, כאשר לדברים אין קשר למציאות ולבסוף אף הודו על טעותם."