תחקיר שקיימו ב'רכבת ישראל' במטרה לגלות מה הסיבה שהובילה למספר רכבות לפעול ביום השבת ולגרום להפרת הסטטוס קוו מגלה: הסיבה לגרמה לכשלים הם שורה של ליקויים חמורים בהתנהלות של רכבת ישראל.
חלקים מן התחקיר פורסמו היום (ראשון) באתר 'ynet', ומהם עולה: כי מה שגרם להפעלתם של רכבות לאחר כניסת השבת - ללא אישור ובניגוד לחוק הם: החלטות סותרות שהתקבלו, היעדר נהלים וחוסר תיאום בין האגפים ברכבת ישראל.
האירועים בהם נסעה הרכבת לאחר כניסת השבת ארעו ביום השישי ה-26 לאוקטובר.
מהתחקיר שקיימו ברכבת עולה, כי לא מעט רכבות הגיעו באיחור של מ-20 דקות ואף יותר משעה. כאשר מספר רכבות הגיעו לתחנות זמן רב לאחר כניסת השבת, כאשר האיחור התבצע במכוון.
הסיבות לאותם שיבושים שגרמו לעיכובים ולחילול השבת, החלו מוקדם בבוקר,כאשר בשעות הבוקר נגרמו שיבושים בשל עבודות תשתית במספר מקומות בארץ.
למרות השיבושים, עולה מהתחקיר שהיערכות הרכבת לראשתם נעשה באופן שאינו מתואם.
לפי התחקיר עולה, כי רק דקות ספורות לפני כניסת השבת, לאחר שברכבת תכננו לדאוג לאספקת אוטובוסים עבור הנוסעים שעוכבו בשל השבושים, בוטלה ההנחיה, וניתנה ההוראה להמשיך את הנסיעה ברכבות גם לאחר כניסת השבת. הסיבה להחלטה על הנסיעה תוך כדי חילול שבת היא: "הבנה כי עצם הזמנת האוטובוסים ומשך הזמן שיידרש להגעתם, יהיה ארוך יותר מנסיעת הרכבות עם נוסעים ליעדם - ובכל מקרה יארך עד לאחר כניסת השבת" ציינו ב-ynet גורמים ב'רכבת ישראל'.
לפי הדיווח, התחקיר מטיל את האשמה על העובדים הזוטרים ברכבת ישראל, למרות שהאשמה אמורה להיות דווקא על בכירי החברה, זאת עקב כך שאין הנחיות מוסדרות להפעלת הכוננים.
מרכבת ישראל נמסר בתגובה ל'ynet', כי הם אינם מתייחסים לתחקירים שאינם סופיים.