הידיעה על מעצרו של בנו הגיעה אל נשיא מועצת חכמי התורה, מרן הרב עובדיה יוסף, רגעים אחדים לפני שפתח בתפילת שחרית.
אחד מבניו של נשיא מועצת החכמים סיפר לו כי הרב יעקב נעצר על-ידי כוחות המשטרה, בשל ההסכמה שנתן ל"תורת המלך".
הנוכחים בתפילה סיפרו כי במהלכה נראה הגר"ע יוסף מכונס בתוך עצמו. "ראו עליו את הכאב הגדול, ואת הזעם", סיפרו מתפללים.
רק לאחר התפילה, כששב לביתו, נודע לגר"ע כי בנו הגר"י שוחרר כעבור חקירה קצרה.
לדברי מקורבים לבית הרב, הגר"ע התבטא בחריפות על המעצר. בין היתר, הוא תקף את המשטרה ושאל: "מי יהיה אחראי לביטול התורה שנגרם בעקבות המעצר?".
בתוך-כך, בעקבות המעצר הציתו כמה צעירים צמיגים בכבישי ירושלים. המחאה צפויה להתרחב עוד יותר לקראת שעות הצהריים.
בשעה 06:45 נעצר הרב יעקב יוסף, בעודו עושה את דרכו חזרה לביתו מתפילת שחרית בותיקין בקבר שמעון הצדיק בירושלים, בעת שהיה בצומת זוועהיל.
הבלשים בלבוש אזרחי, הורו לנהג הרכב בו נסע הרב לעצור, הציגו תעודות והשתלטו על הרכב, הוציאו ממנו את בנו והנהג, ולקחו את הרב לחקירה ברכב הפרטי בו נסע.
הרב נלקח לחקירה במטה הארצי של המשטרה בירושלים, שם חקרו אותו השוטרים במשך 3 דקות בלבד, ולאחר שהות של כחצי שעה במקום, הוא שוחרר חזרה לביתו.