בזמן שלא מעט גורמים שונים מותחים ביקורת על בחירתו של הגאון רבי אליעזר איגרא - מועמד 'הבית היהודי' - לתפקיד דיין בית הדין הגדול, והדרך בה הנציגים החרדים בוועדה התפצלו, בוחר ח"כ יעקב מרגי (ש"ס) לצאת ולשבח את המינוי של הרב איגרא ואומר כי בזכות המריבה הפנימית בין הנציגים החרדים נבחר דיין ראוי.
לדברי מרגי, ששימש כשר הדתות: "יש חיוב למנות דיינים הגונים כי חרב באה לעולם על עיוות הדין. הכיפה לא קובעת הרב איגרא הוא דיין ראוי, תלמיד חכם והגון".
מרגי רמז על הניסיון למנות מקרובים לתפקיד והוסיף כי "כל מי שרוצה שחרב לא תבוא לעולם שיתעלה ולא ימנה מקורבים".
על המחלוקת הפנים-חרדית באשר למינוי הרב איגרא, מרגי מפתיע ואומר כי "כנראה טוב שהחרדים רבים כי על ידי זה מתמנה דיין אחד הגון".
את דבריו שכתב בקבוצת העיתונאים 'המושכים בחוטים' סיים בביקורת חריפה על הפוליטיקה החרדית: "תמשיכו לריב יש זמן כי עוד מעט אין הרכבים ואין בתי דין. בושה וחרפה. לנו - כן לנו".