בשונה מזמני הלימוד מאז קום הישיבה, ארבע מאות תלמידי ישיבת "גרודנא" השוכנת בבאר יעקב, בראשותם של הרב צבי דרבקין והרב יצחק הקר, סיימו אמש (שני) את זמן חורף שנמשך יותר מחצי שנה, כשמיקום הישיבה לזמן קיץ לוט בערפל.
בימים האחרונים, בטרם הסתיים זמן הלימוד הנוכחי, השמועה עברה מפה לאוזן. "בזמן הבא לא נלמד כאן בבאר יעקב אלא נלמד במקום אחר", נאמר לתלמידים. מטעם צוות הישיבה נאמר לתלמידים כי עליהם לארוז את חפציהם ולא להשאירם לזמן הבא כפי שחלקם היו רגילים לעשות בשנים עברו.
הישיבה ממוקמת ברחוב ז'בוטינסקי 28 בבאר יעקב, במגרש בבעלות הרב אליהו רפול. באחרונה פנה הרב רפול אל מנכ"ל ישיבת גרודנא בדרישה להביא לסיום החוזה ביניהם שהוארך שוב ושוב מאז שתוקפו פג לפני שנה.
הרב רפול נקט בצעד זה בעקבות כך שישיבת "כנסת שלום" בראשה הוא עומד צריכה אף היא לפנות את המבנים שברשותה.
ל"כיכר השבת" נודע כי באם לא יחול שינוי דרמתי, תלמידי ישיבת גרודנא יילמדו במבנה חלופי החל מזמן קיץ, בפרדס חנה, מועצה מקומית במחוז חיפה בישראל, או ביישוב יד בנימין.
בשנת תש"ס בעקבות המאבק על השליטה בישיבת פוניבז', ישיבת גרודנא התפצלה לשתיים. קבוצת בחורים עזבה את הישיבה לבאר יעקב עם ראשי הישיבה הנוכחיים. לעומת זאת, קבוצת בחורים נוספת נשארה באשדוד לישיבה בראשות הרב דב צבי קרלנשטיין.