ביטול ביקורו של נשיא המדינה יצחק הרצוג באזרבייג'ן עורר מיני סערה בין ישראל לאזרבייג'ן. אזרבייג'ן הביעה תרעומת על הודעת ישראל בנוגע לביטול, וטענה כי הסיבה האמיתית אינה נובעת משיקולים ביטחוניים כפי שהוצג, אלא מסירוב טורקי לאפשר למטוס "כנף ציון" לחלוף במרחב האווירי שלה.
הרצוג היה אמור להגיע לוועידת האקלים בבאקו ולהשתמש במטוס "כנף ציון", המשרת את ראש הממשלה והנשיא. הודעת הביטול מטעם בית הנשיא ציינה "הערכת מצב ומטעמי ביטחון" כסיבה לביטול, אך גורמים בירושלים הבהירו כי לא הייתה בעיה ביטחונית באזרבייג'ן עצמה.
אזרבייג'ן, לעומת זאת, טענה בתוקף כי הסיבה לביטול היא סירוב טורקי לאפשר למטוס הנשיא הרצוג להשתמש במרחב האווירי שלה. גורם בכיר במשרד החוץ האזרבייג'ני אף הדגיש כי אזרבייג'ן עושה מאמצים רבים לאבטחת האירוע, וכי באקו היא אחת הערים הבטוחות בעולם.
גורמים בישראל אישרו כי הסירוב הטורקי היה אחד הגורמים לביטול, אך טענו כי זו לא הסיבה היחידה או העיקרית. סיבות נוספות שהועלו כללו בעיות ביטחוניות הקשורות לנתיבי טיסה אחרים, על רקע המלחמה בין רוסיה לאוקראינה, וחוסר הרלוונטיות של הביקור לאחר שהרצוג החמיץ את מפגש המנהיגים בשבוע הקודם.