לאחר חקירת ראש הממשלה בנימין נתניהו ביום שישי האחרון במסגרת תיק 1000 ותיק 2000, מגבירה המשטרה את פעילותה גם בתיק 3000 - "פרשת הצוללות". בערוץ 2 דווח כי בעדותו במשטרה בנושא התייחס שר הביטחון לשעבר בוגי יעלון למעורבות ראש הממשלה ברכש כלי השיט.
על פי הדיווח ב-ynet, עדותו של יעלון תחייב את החוקרים לבצע שלל פעולות נוספות, לרבות גביית עדויות מבכירים במשרד הביטחון ובחיל הים, בין היתר בנוגע לאופן שבו התקבלו ההחלטות לרכוש את כלי השיט.
נכון לעכשיו אין בכוונת החוקרים לחקור את ראש הממשלה נתניהו בעניין, אלא רק לאחר שיגבו עדויות משאר המעורבים ויעבירו את החומר ליועץ המשפטי לממשלה, שיצטרך לקבל הכרעה בעניין.
גורמים במשטרה אמרו ל-ynet כי מדובר בפרשה שמתפרשת על פני שנים רבות והיקף החומר בה עצום, כך שיהיה קשה לבצעה במקביל לחקירות 1000 ו-2000 שמתנהלות כעת, וייקח זמן רב עד שניתן יהיה להגיע בה לחקר האמת.
גם בפרשה זו תצטרך המשטרה לבצע חיקורי דין בחו"ל, ובעיקר בגרמניה בה יוצרו הצוללות. זאת, רק אם היועמ"ש יאשר את הפיכת הבדיקה לחקירה.