48 שעות לאחר הודעת היועץ המשפטי לממשלה כי יפתח בחקירה פלילית בפרשת אשכנזי-הרפז, הנחקרים עדיין לא קבלו הודעות על פתיחת החקירה או לוחות זמנים, אך התבשרו על ההתפתחויות בנושא דרך התקשורת.
מצעד הנחקרים בחקירה הפלילית שתנוהל על ידי אגף החקירות של משטרת ישראל בשיתוף מצ"ח יכלול, את הרמטכ"ל לשעבר גבי אשכנזי ואת עוזרו לשעבר ארז וינר. כמו כן עשויים להיחקר שר הביטחון לשעבר אהוד ברק ואנשי לשכתו.
גורמים בקרבת אשכנזי אמרו כי ידרשו בדיקה מקיפה בנושא היחסים העכורים בין לשכת הרמטכ"ל ללשכת שר הביטחון, ויזמנו גורמי בטחון רבים להעיד.
ביום רבעי, יממה לפני הפרסום על פתיחת חקירה פלילית בפרשה, שיגר שר הבינוי והשיכון אורי אריאל מכתב ליועץ המשפטי לממשלה וכן לראש הממשלה, בו הביע את חששו מכך שהפרשה תסתיים בלא כלום.
אריאל שעוד בכהונתו כח"כ היה מאלה שקראו לטיפול מקיף בבעיה, כתב במכתבו: "מתוך היכרותי עם החומרים שהונחו לפני, עוד בטרם חקירת מצ"ח ובתחושת אחריות כבדה, אני קורא לכם להתערב בהמלצות הפצ"ר ולאפשר לחקור את הפרשה עד תום". אריאל הוסיף שלדעתו פרשיה מסוג זה עלולה לפגוע ביסודות המשטר התקין.