ערב יום הכיפורים, במערכת הביטחון גוברת ההיערכות לקראת היום הקדוש. המשטרה, שהעלתה בראש השנה את ההיערכות לכוננות מיוחדת, ממשיכה כך גם במהלך יום כיפור. אלפי שוטרים יעבדו בפריסה מלאה ויוצבו במקומות רגישים.
במשטרת מחוז ירושלים, תוגברה הערנות במיוחד וזאת לאור האירועים האחרונים והאלימות בקרב המוסלמים בשל הסרט שהופץ נגדם. במשטרה יפעלו כדי למנוע חיכוך בין ערבים ליהודים, שוטרים יתפרסו בצירי המתפללים כדי למנוע יידוי אבנים.
בצה"ל, הוחלט להטיל סגר כללי על שטחי יהודה ושומרון ורצועת עזה. הסגר, שהחל הלילה ויימשך עד מוצאי יום כיפור, בחצות הלילה, לא יכלול מקרים הומניטריים ורפואיים.
גם במגן דוד אדום ובארגוני ההצלה נערכים לקראת היום. מנהלי המרחבים במד"א הונחו לעבור לרמת כוננות ג', הגבוהה ביותר של מד"א, וזאת עד למוצאי יום כיפור.
במחוז צפון של המשטרה יתמקדו באבטחת העיר עכו, וזאת, ארבע שנים לאחר המהומות האלימות שפרצו בעיר. במחוז דרום, הונחו השוטרים שאינם במשמרת לשאת נשק אישי לתפילות בבתי הכנסת כדי להבטיח את ביטחונם של המתפללים.
בבתי החולים ברחבי הארץ יעבדו במתכונת חירום, ויתקבלו רק מקרים דחופים שאינם סובלים דיחוי.