בכנס שהתקיים בבית מרן שר התורה הגר"ח קנייבסקי הוקמה הישיבה החדשה 'דרכי ניסים' על שמו ולזכרו של ראש הישיבה הגאון רבי ניסים טולידנו זצ"ל, ראש ישיבת 'שארית יוסף'.
הישיבה הוקמה ע"י נכדו, הגאון רבי אברהם ישעיהו אלקיים יחד עם הגאון רבי אמיתי פוכטוונגר ובהכוונת הגאון רבי מנשה תופיק-אביעזרי.
כמו כן נכנסו רבני הישיבה להתברך אצל ר"י 'בית מתתיהו' הגאון רבי ברוך וייסבקר - שהגר"א אלקיים ראש הישיבה, הוא מתלמידיו, ואצל ר"י 'אורחות תורה' הגאון רבי ברוך דב דיסקין. הרבנים בירכו בחום את ראשי הישיבה על הקמת הישיבה.
הישיבה נמצאת כעת במשכנה הזמני במתחם 'מצפה אשר' שבישוב תל ציון, ולומדים בה כ-20 בחורים מהישיבות אור ישראל, קפלן, וולפסון, אורחות תורה, ועוד, כשבנוסף קיים במקום כולל אברכים חשוב.