המקובל הרב דוב קוק שליט"א השתתף אמש (ד') בסעודת היארצייט לרבה של טבריה הרב רפאל הכהן קוק זצ"ל, יחד עם דודו רבה של רחובות הגאון הרב שמחה קוק ועם וראש ישיבת מאור התלמוד הגאון הרב אברהם יצחק קוק שליט"א ורבנים נוספים מבני המשפחה המיוחסת. המשפחה עלתה קודם לכן לקברו של הרב בבית העלמין הישן בטבריה.
הרב רפאל נולד בליטא בכ"ד אלול תר"ס לרב דב בער הכהן קוק ולאמו מרת רבקה בת נפתלי הרץ לבית שכן.
בצעירותו למד בישיבת טלז ובישיבת מיר שבפולטבה (שם הייתה בזמן מלחמת העולם הראשונה). לאחר מכן חזר למשפחתו שבעיר יליזבטגרד ברוסיה. בתקופה זו כבר חל ברוסיה איסור ללמד תטרה ברבים, אך למרות האיסור המשיך רפאל הצעיר ללמד תורה ולהפיצה ברבים. הוא המשיך בכך עד שלפי המסופר תמונתו הוצגה בחוצות העיר עם מחיר לראשו, ויעצו לו שמן הראוי שלא יחזור הביתה. הרב רפאל ברח לריגה בירת לטביה ומשם עלה לארץ ישראל.
בי"ד באב תרפ"ח נישא למרת בילא רחל, בתו של הרב שמחה מנדלבאום ועבר להתגורר בבית המשפחה, "בית מנדלבאום" (הסמוך לשער מנדלבאום בירושלים שמחוץ לחומות).
לרב רפאל נולדו שישה ילדים: הרב שלמה זצ"ל, הרב שמחה (רבה של רחובות ואב"ד), הרב נחום זצ"ל (רב ברמת גן ואביו של מו"ר הרב דב קוק שליט"א), הרב אברהם יצחק (ראש ישיבת מאור התלמוד, רחובות), הרבנית שרה זהבה (אשת הרב יעקב כץ, ר"מ בישיבת נתיב אריה, ירושלים, והרבנית לאה (אשת הרב אברהם שרמן, דיין בביה"ד הרבני, בני ברק).
בחורף תש"ח נבחר לשמש כרב הראשי של טבריה ואב בית הדין הרבני שבה, ובתפקיד זה כיהן עד יום פטירתו בכ"ב תמוז תשל"א (בחודשים שלאחר בחירתו לרבה של טבריה,אשתו הרבנית רחל העדיפה להישאר בירושלים ולדאוג לחינוך הילדים, הרב רפאל נסע לטבריה והיה חוזר במסירות נפש מידי שבוע לשבות עם משפחתו, עד שבימי מלחמת השחרור חרב בית מנדלבאום בירושלים, ואז עברו גם אשתו והילדים לטבריה).
